Nataša Ž. Kljajić je diplomirala 2000. godine na Poljoprivrednom fakultetu u Zemunu Univerziteta u Beogradu na odseku za melioracije zemljišta. Titulu magistra biotehnike iz oblasti agronomskih nauka (grupa za navodnjavanje), stekla je 2007. godine odbranivši magistarsku tezu pod nazivom: „Optimalni režim navodnjavanja aluvijalnog zemljišta kapanjem pod zasadom maline u Ariljskom malinogorju“ (mentor: prof. dr Jordan Milivojević; članovi komisije: prof. dr Mihailo Nikolić, prof. dr Boško Gajić).
8. februara 2012. godine na Poljoprivrednom fakultetu u Novom Sadu je odbranila doktorsku disertaciju pod nazivom: „Ekonomska efikasnost investicija u različitim uslovima proizvodnje maline“ (mentor prof. dr Dušan Milić; članovi komisije: prof. dr Zorica Sredojević i prof. dr Branislava Gološin) i time stekla naučni stepen doktora poljoprivrednih nauka.
